미쓰야 협정(Mitsuya Agreement)은 1946년 10월 21일 일본과 미군 사이에 체결된 협정으로, 일본의 전후 체제와 미국의 군사적 존재에 대한 내용을 규정하였다. 이 협정은 일본의 평화롭고 안정된 재건을 위한 기반을 마련하는 데 중점을 두었으며, 일본 국내의 정치적, 경제적 상황의 안정성을 추구했다.

협정의 주요 내용은 미군의 일본 내 주둔 및 활동과 관련된 규정을 포함하고 있으며, 일본 정부는 미군의 활동을 지원할 의무가 명시되어 있다. 또한 미쓰야 협정은 일본이 국제사회에서의 역할을 재편성하는 과정에서도 중요한 의미를 지니고 있다.

이 협정은 일본의 정권 재편성 및 민주주의 기반 구축에 기여하였으며, 일본과 미국 간의 관계를 한층 강화하는 계기가 되었다. 미쓰야 협정은 이후 일본의 안전보장 정책 및 미국과의 동맹관계 형성에 중요한 토대가 되었고, 현재에도 일본의 외교 및 군사 정책에 영향을 미치고 있다.