1999년 세계 주니어 피겨 스케이팅 선수권 대회(1999 World Junior Figure Skating Championships)는 국제빙상경기연맹(ISU)이 주관하는 국제 피겨 스케이팅 대회이다. 이 대회는 1998년 11월 22일부터 11월 29일까지 크로아티아의 수도 자그레브(Zagreb)에서 개최되었다. 대회 공식 명칭은 1999년 대회이지만, ISU의 시즌 일정에 따라 실제 경기는 1998년 연말에 치러졌다. 전 세계의 우수한 주니어 피겨 스케이팅 선수들이 참가하여 남녀 싱글, 페어, 아이스 댄스 등 총 네 가지 종목에서 기량을 겨루었다.

남자 싱글 부문에서는 러시아의 일리아 클림킨(Ilia Klimkin)이 금메달을 차지했다. 클림킨은 뛰어난 기술력과 예술성을 바탕으로 심판진의 높은 평가를 받으며 주니어 세계 챔피언에 올랐다. 은메달은 프랑스의 뱅상 레스탕쿠르(Vincent Restencourt)에게 돌아갔으며, 동메달은 일본의 다케우치 요스케(Yosuke Takeuchi)가 획득했다. 이 결과는 당시 남자 주니어 무대에서 러시아, 유럽, 아시아 선수들이 치열한 경쟁을 벌이고 있었음을 보여주는 지표가 되었다.

여자 싱글 부문에서는 러시아 선수들의 강세가 두드러졌다. 러시아의 다리아 티모셴코(Daria Timoshenko)가 총점 1위를 기록하며 금메달을 목에 걸었다. 미국의 사라 휴즈(Sarah Hughes)는 안정적인 기술을 선보이며 은메달을 차지했고, 러시아의 빅토리아 볼치코바(Viktoria Volchkova)가 동메달을 획득했다. 특히 은메달리스트인 사라 휴즈는 이 대회에서의 성과를 바탕으로 시니어 무대에 성공적으로 안착했으며, 훗날 2002년 솔트레이크시티 동계 올림픽에서 금메달을 획득하는 세계적인 선수로 성장했다.

페어 스케이팅 부문에서는 우크라이나의 줄리아 오베르타스와 드미트리 팔라마르추크(Julia Obertas / Dmitry Palamarchuk) 조가 우승을 차지했다. 미국의 로라 핸디와 폴 빈보스(Laura Handy / Paul Binnebose) 조가 은메달을, 러시아의 빅토리아 막시우타와 블라디슬라프 조브니르스키(Victoria Maxiuta / Vladislav Zhovnirski) 조가 동메달을 가져갔다. 아이스 댄스 부문에서는 미국의 제이미 실버스타인과 저스틴 페카렉(Jamie Silverstein / Justin Pekarek) 조가 금메달을 획득했다. 이탈리아의 페데리카 파이엘라와 도메니코 잔니(Federica Faiella / Domenico Zanni) 조는 은메달을, 러시아의 나탈리아 로마니우타와 다닐 바란체프(Natalia Romaniuta / Daniil Barantsev) 조는 동메달을 기록했다.

1999년 주니어 세계선수권 대회는 2000년대 초반 시니어 피겨 스케이팅 무대를 이끌어갈 차세대 유망주들을 미리 확인할 수 있는 중요한 무대였다. 당시 메달을 획득했던 다수의 선수들은 이후 시니어 그랑프리 시리즈와 세계선수권 등 주요 국제 대회에서 활약하며 피겨 스케이팅 역사에 이름을 남겼다. 또한 이 대회는 전통적인 피겨 강국인 러시아의 지속적인 메달 획득 속에서 미국, 프랑스, 일본, 이탈리아 등 다양한 국가의 유망주들이 두각을 나타내며 세계 피겨 스케이팅의 저변이 점차 확대되고 있음을 입증한 대회로 평가받는다.