SEQUENCE CAT은 유전자 서열 분석에 사용되는 생물정보학 도구이다. 이 도구는 DNA나 RNA, 단백질 서열을 연결(concatenate)하고 분석하는 데 주로 활용된다. 여러 개의 서열을 하나의 긴 서열로 결합하거나, 서열들을 특정 순서대로 정렬하는 기능을 제공한다. 또한 서열의 특정 부분을 추출하거나 여러 서열 파일을 하나로 통합하는 데에도 사용된다. SEQUENCE CAT은 대용량 유전체 데이터를 처리할 수 있어 대규모 유전체 프로젝트나 비교 유전체학 연구에서 유용하게 활용된다. 이 도구는 주로 명령줄 인터페이스를 통해 사용되며, 다양한 형식의 서열 파일을 지원한다.