화생방작전통제병은 군대 내에서 화생방 상황 발생 시 이를 효율적으로 관리하고 통제하는 임무를 수행하는 주특기이다. 이들은 주로 상급 부대의 작전통제실이나 지휘소에서 근무하며, 화생방 오염 상황에 대한 정보를 수집, 분석 및 전파하여 지휘관의 의사결정을 보좌한다. 화학병과 중에서도 현장에서 직접 제독이나 탐측을 수행하는 인원들과 달리, 상황실 내에서의 정보 처리와 작전 통제에 특화된 보직이다.

주요 임무 중 하나는 화생방 보고체계인 NBC(Nuclear, Biological, Chemical) 보고서를 작성하고 관리하는 것이다. 예하 부대나 관측소로부터 화생방 공격 상황이 접수되면, 이를 바탕으로 공격의 성격, 위치, 오염 예상 지역 등을 분석한다. 이를 위해 기상 자료를 활용하여 오염운의 확산 경로를 예측하며, 도식화된 정보를 지도에 표시하여 작전 부대가 위험 지역을 피하거나 적절한 방호 조치를 취할 수 있도록 돕는다.

화생방작전통제병은 다양한 통신 장비와 전산 체계를 운용한다. 아군 부대에 화생방 경보를 전파하는 것은 물론, 상급 부대와의 유기적인 정보 공유를 담당한다. 또한 화생방 정찰조나 제독소의 활동 현황을 실시간으로 파악하고, 필요 시 가용 자원의 배치와 이동을 제안하는 등 자원 관리의 측면에서도 중요한 역할을 수행한다. 상황 발생 초기 대응부터 종료 후 사후 분석까지 전 과정에 걸쳐 데이터 기록을 유지한다.

이 주특기를 수행하기 위해서는 높은 수준의 정보 처리 능력과 침착함이 요구된다. 긴박한 전투 상황 속에서 쏟아지는 수많은 정보를 정확하게 선별하고 신속하게 처리해야 하기 때문이다. 따라서 군사 교육 과정에서는 화생방 작전 이론, 오염 예측 방법론, 전산 시스템 운용법 등을 집중적으로 학습한다. 특히 화학 작용제의 종류별 특성과 인체 영향, 방호 물자의 효율적 운용 방안에 대한 전문 지식이 필수적이다.

현대전에서 화생방 무기의 위협이 지속됨에 따라 화생방작전통제병의 중요성은 더욱 증대되고 있다. 비가시적인 위협인 화생방 공격을 가시적인 정보로 변환하여 부대의 생존성을 보장하고 전투력을 보존하는 핵심적인 역할을 하기 때문이다. 이들은 지휘소 내에서 과학적 분석과 신속한 통제를 통해 부대의 피해를 최소화하는 화생방 방어 체계의 중추적 연결고리라 할 수 있다.