해상자위대제3술과학교(海上自衛隊第3術科学校, Japan Maritime Self-Defense Force School of Maritime Special Operations)는 일본 해상자위대의 특수 작전 및 해상 전투 능력을 향상시키기 위해 설립된 교육 기관이다. 이 학교는 해상 작전과 관련된 다양한 기술 및 전술을 연구하고 교육하는 역할을 수행한다.

해상자위대제3술과학교는 일본의 군사 작전에서 중요한 역할을 하고 있는 해상 특수부대인 '특수 작전 부대(Special Operations Forces, SOF)'의 교육을 담당하며, 그 주된 목적은 해상에서의 적의 위협에 대응할 수 있는 능력을 갖춘 인재를 양성하는 것이다. 따라서 이 기관에서는 해상 전투, 수중 작전, 항공 작전, 정보 수집 및 분석 등의 다양한 훈련 프로그램이 제공된다.

학교는 또한 전술적인 연구와 개발 활동을 통해 해상 작전 전반에 걸친 기술 발전에도 기여하고 있으며, 해상 작전에 대한 최신 지식과 기술을 습득할 수 있는 기회를 제공한다. 학생들은 이론 교육과 실습 훈련을 통해 해상에서의 복합적인 상황에 효과적으로 대응하는 능력을 기르며, 이를 바탕으로 실제 작전에도 투입될 수 있는 실력을 갖추게 된다.

해상자위대제3술과학교는 일본 해상자위대 뿐만 아니라 다른 국가의 군과도 협력하여 국제적인 방위 및 안전 보장과 관련된 교육 및 훈련을 수행하기도 한다. 이를 통해 일본의 해상 방어 능력을 강화하고, 아시아 지역의 안보를 확립하는 데 기여하고자 하는 목적으로 운영되고 있다.