특수종(特殊種)은 생물학에서 특정한 환경이나 생태계의 조건에 적응하여 독특한 형태와 생리적 특성을 가진 생물 종을 의미한다. 이러한 종들은 생태적 지위나 생존 전략이 다른 생물과 차별화되며, 그들의 생태계 내에서 중요한 역할을 수행한다.

특수종은 종종 고립된 지역이나 특정한 서식지에서 발견되며, 그로 인해 유전적 다양성이 제한될 수 있다. 하지만 이러한 제한된 서식지는 종의 생명 주기와 진화에 맞춘 매우 특수한 생리와 행동을 유도할 수 있다. 예를 들어, 특정 섬에만 서식하는 생물들은 그 섬의 독특한 환경적 요인에 적응하여 다른 지역의 동일종과는 다른 형태적, 생리적 특성을 지닐 수 있다.

특수종의 보존은 생물 다양성을 유지하고 에코시스템의 건강성을 확보하는 데 필수적이다. 이들 종이 멸종하게 되면 해당 생태계의 구조와 기능이 크게 변화할 수 있으며, 이는 전체 생태계에도 부정적인 영향을 미친다. 따라서 생물 보전 전략에서는 특수종에 대한 보호와 관리가 중요한 요소로 다뤄진다.