토마스 홀리(Thomas Holley, 1868년 ~ 1934년)는 영국의 생리학자이자 생화학자로, 특히 세포의 대사 과정과 에너지 전환에 관한 연구로 잘 알려져 있다. 그는 생물체가 에너지를 어떻게 생산하고 사용하는지 이해하는 데 기여한 공로로 인정받았다.

홀리는 케임브리지 대학교에서 교육을 받았으며, 이후 여러 연구 기관에서 활동하였다. 그의 연구는 주로 세포 호흡, 에너지 대사 및 생체 분자의 역할에 초점을 맞추었다. 홀리는 당대의 다른 과학자들과 협력하여 여러 중요한 발견을 이루었으며, 특히 세포 내 미토콘드리아의 기능과 그것이 세포 에너지 생산에 미치는 영향에 대한 연구로 주목받았다.

그의 연구 결과는 생리학, 생화학 및 의약학 분야에 중요한 기초가 되었다. 홀리는 과학 저널에 다수의 논문을 발표하였고, 그의 업적은 후속 연구에 큰 영향을 미쳤다. 1934년에 사망한 이후에도 그의 연구는 현대 생리학과 생화학의 발전에 기여하고 있다.