코브라 커맨더(Cobra Commander)는 "지.아이.조"(G.I. Joe) 시리즈에 등장하는 가공의 악당 캐릭터이자 코브라(Cobra) 조직의 리더이다. 코브라 커맨더는 시리즈 내에서 주적으로 등장하며, 그의 목표는 세계 정복이다. 코브라 커맨더는 항상 자신의 얼굴을 가리기 위해 헬멧이나 마스크를 착용한다. 이 캐릭터는 하스브로가 1982년에 처음으로 도입했으며, 만화, 애니메이션, 영화 등 다양한 매체에서 주요 빌런으로 등장한다.

코브라 커맨더는 매우 교활하며, 카리스마 있고 독재적인 리더로 묘사된다. 그가 이끄는 코브라 조직은 테러리즘, 범죄, 과학적 변칙 행위 등을 통해 세계 정복을 시도한다. 코브라 커맨더는 뛰어난 전략가이자 전술가로, 다양한 무기 시스템과 로봇 등을 사용하여 지.아이.조 팀과 대치한다.

코브라 커맨더의 배경 이야기는 매체마다 약간씩 다르지만, 일반적으로 그는 일반적인 사람에서 시작해 코브라라는 거대 테러 조직을 창설한 인물로 그려진다. 그의 진짜 이름과 얼굴은 대부분의 매체에서 비밀로 남겨져 있다. 캐릭터의 기본 설정은 시리즈마다 약간씩 변형되지만, 그는 항상 자신의 이상을 실현하기 위해 어떤 수단도 가리지 않는 위험한 빌런으로 그려진다.

코브라 커맨더는 다양한 배우와 성우들에 의해 연기되었으며, 그의 가장 유명한 목소리 연기는 초기 애니메이션 시리즈에서 크리스 라타(Chris Latta)가 맡았다. 영화에서는 조지프 고든 레빗(Joseph Gordon-Levitt)이 코브라 커맨더 역할을 맡아 연기했다.