종축(種軸)은 생물 분류학에서 종들을 계통적으로 배열하기 위해 사용하는 기준선 또는 축을 의미한다. 주로 계통수나 발생 계통도를 그릴 때, 각 종의 진화적 관계를 보여주는 데 사용된다. 종축은 일반적으로 종이 가지는 친연성과 진화적 거리를 나타내기 위해 수직 또는 수평으로 배치된다.

종축은 다양한 생물군의 분화를 이해하는 데 도움을 주며, 각 생물종이 언제, 어떻게 진화했는지를 시각적으로 표현한다. 동시에 동일한 조상의 후손으로 이어지는 종들 간의 관계를 명확히 하여, 이러한 진화적 변화를 통해 생물의 다양성을 탐구하는 데 기여한다.

또한, 종축은 단순한 분류 작업을 넘어서 생물학적 연구, 생태학, 보존 생물학 등 다양한 분야에서 광범위하게 활용된다. 각 종의 특성과 생태적 역할을 고려하여, 생물체 간의 상호작용 및 환경 적응 등을 연구하는 데 필요한 기초 자료를 제공한다.