운하충(運河蟲)은 물속에서 살며 유영하는 미세한 생물군으로, 주로 담수나 해수의 운하 및 수로와 같은 인공적인 환경에서 발견된다. 이들은 일반적으로 몸 길이가 수 밀리미터에 불과하며, 다양한 색깔과 형태로 나타난다. 운하충은 생태계에서 중요한 역할을 하며, 주로 미세한 플랑크톤이나 유기물, 조류 등을 먹고 산다.
운하충은 생식 방식으로 무성 생식을 통해 번식하며, 환경 조건이 적절할 경우 단기간에 대량으로 번식할 수 있다. 이들은 생태계의 먹이망에서 중요한 위치를 차지하며, 물속에서 다른 생물들의 먹이가 되기도 한다. 이와 함께, 운하충은 수생 생태계의 건강성을 나타내는 지표로 사용되기도 한다.
운하충의 서식지는 대개 산소 농도가 높은 깨끗한 물에서 발견되지만, 오염된 수역에서도 생존할 수 있어 그 저항력 및 적응력이 돋보인다. 이들은 환경 변화에 민감하게 반응하므로, 수질 평가나 생태계 복원 연구에서 중요한 연구 대상이 된다.