시타델 함대(Citadel Fleet)는 바이오웨어의 SF 게임 시리즈 '매스 이펙트(Mass Effect)' 세계관에 등장하는 연합 우주 함대이다. 이 함대는 은하계 정치, 경제, 문화의 중심지이자 초거대 우주 정거장인 '시타델'을 방어하는 것을 주 임무로 한다. 단일 종족으로 구성된 것이 아니라 시타델 평의회를 구성하는 주요 외계 종족들의 함선이 연합하여 편성되어 있으며, 그중에서도 군사력이 가장 강력하고 규율이 엄격한 투리안(Turian) 종족이 전력의 대다수를 차지하며 주축을 담당한다.

함대의 지휘 체계 정점에는 아사리(Asari) 종족의 초거대 드레드노트급 전함인 '데스티니 어센션(Destiny Ascension)'이 기함으로 자리 잡고 있다. 데스티니 어센션은 은하계 내에서 가장 강력한 화력과 방어력을 지닌 단일 함선 중 하나로 꼽히며, 시타델 함대와 평의회 권위의 상징적인 존재이다. 주력 전투 부대는 투리안의 순양함과 호위함들이 맡고 있으며, 아사리와 살라리안(Salarian)의 함선들이 화력 지원 및 전자전을 보조한다. 이들은 고도로 훈련된 승무원들과 최첨단 기술로 무장하고 있어 시타델 권역 내에서 가장 강력한 억제력을 가진 무력 집단으로 평가받는다.

매스 이펙트 1편의 클라이맥스인 '시타델 전투'에서 이 함대는 리퍼(Reaper) 소버린과 게스(Geth) 함대의 기습 공격에 맞서 치열한 방어전을 펼쳤다. 당시 리퍼의 압도적인 기술력과 방어막 앞에 시타델 함대는 전멸에 가까운 피해를 입을 위기에 처했으나, 플레이어인 셰퍼드 소령의 전술적 선택에 따라 함대의 운명이 갈리게 된다. 의회를 구출하기 위해 함대를 희생할 경우 주력함인 데스티니 어센션을 포함한 많은 함선이 파괴되지만, 반대로 소버린 공격에 집중할 경우 의회는 희생되더라도 함대의 주 전력은 보존되는 분기점이 존재한다.

매스 이펙트 3편의 리퍼 전면 침공 당시에도 시타델 함대는 은하계 방어의 핵심 전력으로 기능했다. 전쟁 초기 각 종족이 모성을 방어하기 위해 병력을 철수시키는 와중에도, 시타델 방어 함대는 정거장을 수호하며 밀려드는 피난민들을 보호하고 행정 기능을 유지하는 임무를 수행했다. 게임의 최후반부 지구 탈환 작전에서는 시타델이 지구 궤도로 이동함에 따라 연합군 함대에 합류하여 리퍼와의 마지막 결전에 참여하게 되며, 이는 은하계 종족들이 서로 협력하여 거대한 위협에 맞서는 상징적인 모습을 보여준다.

설정상 시타델 함대는 단순한 군사 조직을 넘어 은하계의 질서와 안정을 유지하는 평화 유지군으로서의 성격을 띤다. 투리안의 군사적 규율, 아사리의 바이오틱 능력 및 함선 기술, 살라리안의 정보전 능력이 결합된 이 함대는 시타델 조약 가입국들에게는 안전보장의 핵심이다. 그러나 동시에 인류를 포함한 신생 종족이나 터미너스 지대의 범죄 조직들에게는 의회의 권력을 강제하는 압도적이고 배타적인 무력 수단으로 인식되기도 하여, 매스 이펙트 세계관 내의 복잡한 정치 역학을 대변하는 중요한 소재로 다뤄진다.