생흔화석(生痕化石, ichnofossil)은 생물의 활동이나 행동을 나타내는 흔적이 돌이나 퇴적물에 남아 형성된 화석이다. 이러한 화석은 주로 생물체의 직접적인 형태가 아닌, 생물의 행동이나 생태적 상호작용에 의해 남긴 흔적으로서, 다양한 생물에 의한 도구 및 서식지의 변형, 갉기, 굴착, 걸을 때 남기는 자국 등을 포함한다.
생흔화석은 그러므로 생물의 신체적 형상과는 달리 생물학적 및 생태학적 정보의 기록으로 해석된다. 이러한 화석들은 주로 패각(껍데기)이나 골격의 화석과는 다른 연구 분야에서 다뤄지며, 고생물학자들은 생흔화석을 통해 과거의 생태계와 생물 간 상호작용, 진화 과정을 연구한다.
생흔화석의 예로는 동물의 발자국, 파먹은 흔적, 구멍을 지닌 암석, 그리고 식물에 의해 남겨진 흔적 등이 있다. 이러한 흔적들은 퇴적층 내에서 발견되며, 특정 지층의 상대적 연대나 환경을 해석하는 데 중요한 단서를 제공한다. 생흔화석은 고생물학적 연대 측정, 생물다양성 연구, 그리고 고환경 복원에 있어 핵심적인 역할을 한다.