블루 젠더(Blue Gender)는 1999년에 방영된 일본의 애니메이션 시리즈로, 감독은 히가 시게루이고, 제작사는 이치바로, 키우츠(NEW) 등의 팀이 참여하였다. 이 작품은 포스트 아포칼립스 및 SF 장르에 속하며, 인간과 외계 생물체의 충돌을 다룬다.
이야기는 21세기 말, 지구의 환경이 극도로 악화되고 인류가 우주로 이동하게 되는 상황에서 시작된다. 주인공인 유리 코마츠는 병에 걸려 냉동 수면 상태에 들어갔고, 수십 년 후에 깨어난다. 하지만 지구는 '블루'라는 이름의 거대한 생물체들로 가득 찬 황폐한 상태로 변해 있다. 블루는 체내에 독소를 포함하고 있어 인간에게 위협이 되는 존재이다.
소설적 배경 속에서 인류는 잔여 자원과 안전한 생존을 추구하며 블루와의 전투를 위해 군사조직을 조직한다. 이 과정에서 유리는 블루와 싸우는 전사들, 특히 '지구의 방패'라는 부대와 함께 블루의 정체와 그것들이 존재하게 된 이유에 대해 알아가게 된다.
블루 젠더는 그들의 전투와 우정, 그리고 인간 존재에 대한 고민을 중심으로 전개된다. 시리즈는 세계관의 독창성과 강렬한 액션 장면, 그리고 복잡한 캐릭터 관계로 주목받았으며, 후에 OVA로도 제작되었다. 이 애니메이션은 SF 애니메이션의 한 예로, 인간과 환경, 그리고 생명체 사이의 관계를 탐구하고 있다.