방위군 본부는 국가의 방위와 군사 작전을 계획하고 조정하는 기관이다. 일반적으로 군의 최고 지도부로서 군사 전략, 인력 관리, 교육 및 훈련, 자원 배분 등의 기능을 수행한다. 방위군 본부는 군의 각 군종(육군, 해군, 공군 등)과 부대들 간의 협력과 조화를 강화하기 위해 다양한 정책과 지침을 수립한다.

이 기관은 국가 안보와 관련된 정보 수집 및 분석을 통해 위협 요소를 파악하고, 이에 대한 대응 계획을 수립한다. 또한, 국내외 군사 훈련 및 작전에 대한 지휘 및 감독 기능도 포함된다. 방위군 본부는 국가의 정책 변화나 국제 정세에 따라 유연하게 작전 계획을 수정하고, 필요 시 민간 기관 및 국제 기구와의 협력을 통해 통합적인 방위 전략을 마련한다.

방위군 본부의 구조와 운영 방식은 각국의 군사 체계와 조직에 따라 다르며, 일반적으로 군 총장이나 최고 지휘관의 직접적인 지휘 아래에서 운영된다. 이 기관은 방위 정책 수립뿐만 아니라, 군인들의 복지, 훈련 및 장비 발전에도 관여하여 전반적인 군의 전투력을 증대시키는 역할을 수행한다.