미스캐토닉 대학(Miskatonic University)은 H.P. 러브크래프트의 작품에 등장하는 허구의 대학이다. 이 대학은 주로 "미스캐토닉"이라는 가상의 도시인 아크햄에 위치하고 있으며, 러브크래프트의 여러 단편 소설과 소설들에서 언급된다.

미스캐토닉 대학은 주로 고대의 금지된 지식, 오컬트 및 초자연적 현상에 관련된 학문적 연구로 널리 알려져 있다. 대학의 도서관은 방대한 양의 고서와 희귀 문서들을 소장하고 있으며, 그 중 일부는 인간의 이해를 초월하는 내용을 포함하고 있다. 이 도서관은 특히 "네크로노미콘"이라는 허구의 금서와 관련하여 전설적인 존재로 여겨진다.

미스캐토닉 대학은 종종 미스터리하고 불길한 분위기를 지니며, 학생들은 초자연적인 존재와의 접촉, 신비로운 신화, 그리고 인간 존재의 한계를 뛰어넘는 실험을 수행하는 이야기 속 주인공들로 등장한다. 이 대학은 러브크래프트 우주(Cthulhu Mythos)에서 중요한 중심지로 기능하며, 그로 인해 다양한 공포와 불안의 요소를 탐구하는 작품에 지속적으로 등장한다.

미스캐토닉 대학은 허구의 설정이지만, 러브크래프트의 영향을 받은 현대의 많은 문화 작품에서 오마주 또는 참조의 형태로 나타나기도 한다.