군종 목사(軍宗牧師)는 군대 내에서 군인들에게 종교적 서비스와 영적 지도를 제공하는 목사이다. 군종 목사는 군인의 신앙생활을 지원하고, 그들의 정신적, 정서적 건강을 도모하기 위해 군사 서비스에 전념한다. 이들은 군사 사역의 필요에 따라 다양한 종교 활동을 조직하고, 예배, 기도회, 성경 공부와 같은 프로그램을 진행한다.

한국 군종 목사는 대체로 군종사관학교에서 정규 교육을 받은 뒤 군에 배치된다. 이들은 기독교에 기반을 두고 있으나, 일부 군대에서는 다른 종교의 사제나 경전도 포함되기도 한다. 군종 목사는 군인 외에도 그들의 가족을 위한 상담과 지원 서비스를 제공하기도 하며, 위기 상황에서 군인들에게 심리적 지지 역할을 수행한다.

일반적으로 군종 목사는 군대 내부의 다양한 사목 활동을 통해 군인들의 신앙과 군 생활을 조화롭게 유지하고, 복무 중 겪는 스트레스와 고난을 함께 이겨낼 수 있도록 도와준다. 이들은 군대 내에서 종교의 자유를 존중하며, 다양한 종교적 배경을 가진 군인들과의 신뢰 관계를 쌓는 데 중점을 둔다.