오모토역(大元駅, Omoto Station)은 일본 홋카이도 하코다테시에 위치한 철도역이다. 이 역은 홋카이도 여객철도(홋카이도 JR)의 주요 노선 중 하나인 하코다테 본선에 속한다. 오모토역은 1914년 5월 1일에 개업하였으며, 이후 지역 주민과 여행객에게 중요한 교통 편리성을 제공하고 있다.

역의 구조는 단순한 측면을 가지고 있으며, 일정한 규모의 대합실과 승강장이 배치되어 있다. 승강장은 일반적으로 1면 1선의 형태로 이루어져 있다. 오모토역은 주로 지역 주민의 이용이 많으며, 근처에는 주택가와 상업시설이 분포해 있다.

역 주변에는 자연경관이 아름다운 지역이 많아 관광객들도 종종 찾는 곳이다. 특히 강이나 호수 등과 가까워 여름철에는 피크닉이나 레포츠를 즐기기 좋은 장소로 알려져 있다. 현재 오모토역은 정기적인 운행이 이루어지고 있으며, 지역 사회에서 중요한 역할을 하고 있다.